Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup160Q9Z0W3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup160Q9Z0W3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms