Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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