Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn2Q9Z0I6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn2Q9Z0I6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms