Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn3Q9Z0G9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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