Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx9Q9WUH2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms