Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms