Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sept6Q9R1T4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sept6Q9R1T4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms