Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms