Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms