Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphs1Q9QZS7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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