Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a4Q9QZR9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms