Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms