Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms