Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt3Q9QZ47 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms