Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rdh11Q9QYF1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rdh11Q9QYF1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rdh11Q9QYF1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rdh11Q9QYF1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rdh11Q9QYF1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rdh11Q9QYF1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rdh11Q9QYF1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rdh11Q9QYF1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh11Q9QYF1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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