Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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VapbQ9QY76 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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VapbQ9QY76 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VapbQ9QY76 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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