Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx4Q9QY61 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms