Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpsf3Q9QXK7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms