Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms