Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms