Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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