Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrac1Q9JKP8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms