Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms