Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms