Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpf2Q9JJ80 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms