Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm9sf3Q9ET30 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms