Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms