Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms