Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms