Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cse1lQ9ERK4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms