Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clstn2Q9ER65 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms