Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms