Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms