Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms