Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms