Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms