Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms