Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms