Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn3Q9DAD6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pfn3Q9DAD6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pfn3Q9DAD6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pfn3Q9DAD6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn3Q9DAD6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms