Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms