Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem239Q9DA47 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms