Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Subh2bvQ9D9Z7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Subh2bvQ9D9Z7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms