Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms