Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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