Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms