Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms