Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp4bQ9D8B3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chmp4bQ9D8B3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms