Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fip1l1Q9D824 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms