Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms