Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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